Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF6BO95407 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms