Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN1O94985 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN1O94985 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms