Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF6O94906 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF6O94906 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms