Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24DO94855 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24DO94855 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms