Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG12O94817 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG12O94817 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG12O94817 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG12O94817 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG12O94817 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG12O94817 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG12O94817 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG12O94817 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG12O94817 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG12O94817 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG12O94817 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG12O94817 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG12O94817 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG12O94817 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG12O94817 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG12O94817 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG12O94817 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG12O94817 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG12O94817 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG12O94817 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG12O94817 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG12O94817 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms