Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNKO75909 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNKO75909 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNKO75909 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNKO75909 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNKO75909 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNKO75909 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNKO75909 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNKO75909 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNKO75909 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNKO75909 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNKO75909 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNKO75909 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNKO75909 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNKO75909 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNKO75909 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNKO75909 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNKO75909 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNKO75909 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNKO75909 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNKO75909 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNKO75909 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNKO75909 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNKO75909 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms