Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN15O75808 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN15O75808 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN15O75808 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms