Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F6O75461 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F6O75461 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F6O75461 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2F6O75461 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F6O75461 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F6O75461 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F6O75461 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F6O75461 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F6O75461 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F6O75461 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F6O75461 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2F6O75461 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
E2F6O75461 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F6O75461 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F6O75461 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms