Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP12O75317 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP12O75317 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP12O75317 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP12O75317 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP12O75317 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP12O75317 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP12O75317 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP12O75317 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP12O75317 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP12O75317 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP12O75317 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP12O75317 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP12O75317 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP12O75317 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP12O75317 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP12O75317 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP12O75317 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP12O75317 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP12O75317 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP12O75317 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP12O75317 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP12O75317 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP12O75317 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP12O75317 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP12O75317 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP12O75317 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP12O75317 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP12O75317 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP12O75317 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP12O75317 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP12O75317 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP12O75317 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP12O75317 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP12O75317 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP12O75317 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP12O75317 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP12O75317 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP12O75317 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP12O75317 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP12O75317 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP12O75317 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP12O75317 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP12O75317 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP12O75317 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP12O75317 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP12O75317 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP12O75317 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP12O75317 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP12O75317 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP12O75317 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP12O75317 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP12O75317 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP12O75317 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP12O75317 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP12O75317 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP12O75317 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms