Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOBOXO60393 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOBOXO60393 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms