Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG3O60359 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG3O60359 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms