Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SUSD5O60279 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUSD5O60279 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD5O60279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms