Protein–RNA interactions for Protein: O60243

HS6ST1, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST1O60243 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HS6ST1O60243 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HS6ST1O60243 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS6ST1O60243 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms