Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP9BO43861 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms