Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT86O43790 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT86O43790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT86O43790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT86O43790 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT86O43790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT86O43790 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT86O43790 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT86O43790 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT86O43790 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT86O43790 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT86O43790 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT86O43790 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT86O43790 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT86O43790 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT86O43790 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT86O43790 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT86O43790 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT86O43790 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT86O43790 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT86O43790 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT86O43790 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT86O43790 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT86O43790 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT86O43790 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT86O43790 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT86O43790 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT86O43790 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT86O43790 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT86O43790 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT86O43790 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT86O43790 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT86O43790 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT86O43790 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT86O43790 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT86O43790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT86O43790 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT86O43790 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT86O43790 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT86O43790 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT86O43790 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT86O43790 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT86O43790 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT86O43790 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT86O43790 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT86O43790 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT86O43790 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT86O43790 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT86O43790 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT86O43790 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT86O43790 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT86O43790 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT86O43790 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT86O43790 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT86O43790 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT86O43790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT86O43790 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT86O43790 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT86O43790 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT86O43790 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT86O43790 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT86O43790 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT86O43790 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT86O43790 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms