Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATCO43716 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATCO43716 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATCO43716 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATCO43716 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATCO43716 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATCO43716 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATCO43716 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATCO43716 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATCO43716 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATCO43716 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATCO43716 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATCO43716 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATCO43716 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATCO43716 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATCO43716 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATCO43716 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATCO43716 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATCO43716 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATCO43716 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATCO43716 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATCO43716 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GATCO43716 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATCO43716 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATCO43716 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATCO43716 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATCO43716 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATCO43716 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATCO43716 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATCO43716 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms