Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CBFA2T2O43439 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBFA2T2O43439 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBFA2T2O43439 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms