Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1CO15160 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1CO15160 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1CO15160 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms