Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHOX2AO14813 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms