Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1O00291 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1O00291 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1O00291 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1O00291 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1O00291 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1O00291 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIP1O00291 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIP1O00291 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIP1O00291 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIP1O00291 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIP1O00291 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HIP1O00291 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIP1O00291 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIP1O00291 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIP1O00291 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIP1O00291 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIP1O00291 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIP1O00291 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIP1O00291 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIP1O00291 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIP1O00291 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIP1O00291 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIP1O00291 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIP1O00291 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIP1O00291 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIP1O00291 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIP1O00291 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIP1O00291 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HIP1O00291 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIP1O00291 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIP1O00291 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIP1O00291 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HIP1O00291 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIP1O00291 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIP1O00291 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIP1O00291 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIP1O00291 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIP1O00291 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIP1O00291 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIP1O00291 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIP1O00291 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIP1O00291 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIP1O00291 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIP1O00291 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIP1O00291 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIP1O00291 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIP1O00291 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIP1O00291 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIP1O00291 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIP1O00291 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms