Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QW42 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QW42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QW42 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QW42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QW42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QW42 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QW42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QW42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QW42 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QW42 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QW42 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QW42 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QW42 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QW42 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QW42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QW42 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QW42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QW42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QW42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QW42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QW42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QW42 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QW42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms