Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QR89 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QR89 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QR89 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QR89 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QR89 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QR89 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QR89 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QR89 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QR89 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QR89 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
J3QR89 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QR89 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QR89 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QR89 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QR89 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QR89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QR89 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QR89 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QR89 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QR89 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QR89 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QR89 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QR89 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QR89 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QR89 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QR89 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QR89 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QR89 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QR89 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QR89 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QR89 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QR89 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QR89 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms