Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms