Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VP50 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VP50 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VP50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VP50 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VP50 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VP50 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VP50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VP50 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VP50 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VP50 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VP50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VP50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VP50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VP50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VP50 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VP50 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VP50 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F8VP50 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F8VP50 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F8VP50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F8VP50 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F8VP50 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VP50 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VP50 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VP50 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VP50 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VP50 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VP50 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VP50 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VP50 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VP50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VP50 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VP50 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VP50 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VP50 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F8VP50 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F8VP50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F8VP50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8VP50 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8VP50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8VP50 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
F8VP50 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8VP50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F8VP50 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8VP50 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8VP50 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8VP50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8VP50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F8VP50 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
F8VP50 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F8VP50 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F8VP50 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F8VP50 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F8VP50 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F8VP50 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F8VP50 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F8VP50 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
F8VP50 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F8VP50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
F8VP50 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F8VP50 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F8VP50 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F8VP50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F8VP50 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F8VP50 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F8VP50 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms