Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM238C9JI98 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM238C9JI98 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms