Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NOTOA8MTQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NOTOA8MTQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms