Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P5A8MQ11 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PMS2P5A8MQ11 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P5A8MQ11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms