Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS3P2A8K0S8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS3P2A8K0S8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms