Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC69A6NI79 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC69A6NI79 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms