Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NCN8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NCN8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NCN8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NCN8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NCN8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NCN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NCN8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NCN8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NCN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NCN8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NCN8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NCN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NCN8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NCN8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NCN8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NCN8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NCN8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NCN8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NCN8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NCN8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NCN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NCN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NCN8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NCN8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NCN8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NCN8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NCN8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A6NCN8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NCN8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NCN8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NCN8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NCN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NCN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NCN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NCN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NCN8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NCN8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NCN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NCN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NCN8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NCN8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NCN8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NCN8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NCN8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms