Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MAP1LC3B2A6NCE7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms