Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF27A3QJZ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms