Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRAMEF22A3QJZ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PRAMEF22A3QJZ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms