Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO3A2RU48 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMCO3A2RU48 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMCO3A2RU48 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms