Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC189A1A4V9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC189A1A4V9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC189A1A4V9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms