Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PP18

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PP18 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PP18 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PP18 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PP18 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PP18 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PP18 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PP18 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PP18 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A1W2PP18 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PP18 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms