Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC196A0A1B0GTZ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC196A0A1B0GTZ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC196A0A1B0GTZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC196A0A1B0GTZ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC196A0A1B0GTZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC196A0A1B0GTZ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms