Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms