Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0B4J2C4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0B4J2C4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0B4J2C4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms