Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms