Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHANK2Q9UPX8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms