Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms