Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms