Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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UPB1Q9UBR1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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UPB1Q9UBR1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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UPB1Q9UBR1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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UPB1Q9UBR1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPB1Q9UBR1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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