Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VPS29Q9UBQ0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms