Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms