Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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