Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL11Q9NVR0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms