Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NRIP3Q9NQ35 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NRIP3Q9NQ35 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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