Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms